Учеными разработан новый метод обнаружения рака по образцам крови с коррекцией ошибок. Этот метод, основанный на полногеномном секвенировании ДНК, демонстрирует значительно более высокую чувствительность и точность по сравнению с предыдущими методами. Исследователи использовали коммерческую платформу для секвенирования от Ultima Genomics, которая обеспечивает высокую «глубину» покрытия — показатель качества данных секвенирования. Это позволило обнаруживать чрезвычайно низкие концентрации циркулирующей опухолевой ДНК.
Предложенный подход открывает новые возможности для рутинного скрининга на основе анализа крови для раннего выявления рака. Технология «жидкостной биопсии», основанная на анализе крови, может революционизировать лечение рака. Однако выявление мутационных признаков рака по крошечным концентрациям опухолевой ДНК в образцах крови сопряжено с серьезными трудностями. В этом исследовании ученые пошли дальше, показав, что доступная стоимость новой платформы для секвенирования позволяет проводить полногеномное секвенирование.
Используя только эту платформу и известные мутационные паттерны, они смогли обнаружить ДНК опухоли в образцах крови пациентов в чрезвычайно низких концентрациях. Затем команда повысила точность этого подхода с помощью метода исправления ошибок, который использует избыточную информацию в естественной двухцепочечной ДНК. Результаты исследования демонстрируют потенциал нового метода для выявления и оценки очень низких уровней онкомаркеров у пациентов с раком мочевого пузыря и меланомой только по образцам крови. Внедрение этого метода ранней диагностики онкозаболеваний может спасти сотни тысяч жизней.
Ранее мы писали о способе ранней диагностики рака легких.
